Кафедра лесоведения и агроэкологии образована решением попечительского совета НАУА от 6 ноября 2018 г. в результате объединения кафедр агроэкологии и лесоведения.
Кафедра агроэкологии была образована в 1999 г. Основателем и первым руководителем кафедры стал профессор Э.М. Айрапетян. В 2008-2018 гг. должность заведующего занимал доктор с.-х. наук, профессор М.А. Галстян.
На кафедре ведется обширная научная, исследовательская, учебно-методическая работа, совершенствуются и приводятся в соответствие с международными стандартами учебные программы.
Проблемная лаборатория агроэкологии в рамках сотрудничества НАУА с университетами Фрезно и Нью Джерси (США) осуществляет грантовую научную программу “Разработка технологий производства экологически безопасной продукции растениеводства на техногенно загрязненных почвах РА”.
На кафедре с 2014 г. совместно с министерствами экологии Польши и Армении при участии кафедры химической экологии ЕГУ, кафедры экологии здравоохранения Российско-армянского (Славянского) университета реализуется финансируемая ЕС трехлетняя учебная программа “Управление отходами и охрана окружающей среды”.
В рамках сотрудничества кафедры с Московской сельскохозяйственной академией им. К.А. Тимирязева с 2010 г. в ежегодной летней экологической школе проходят переподготовку 3-5 молодых преподавателей, аспирантов и магистрантов кафедры, с 2016 г. шесть сотрудников прошли переподготовку в режиме онлайн, а магистранты, обучающиеся в рамках программы TEMPUS “Новейшие экологические технологии”, повышают свою квалификацию в Португалии и Испании.

Кафедра лесоведения была образована в 2003 г. на базе кафедры экологии. Ее основателем и первым руководителем был член-корреспондент НАН РА, доктор биологических наук, профессор Ж.Варданян. Неоценимый вклад в преподавание лесоведческих дисциплин и подготовку специалистов по лесоведению внес профессор П.А. Хуршудян. По его инициативе была восстановлена некогда преподаваемая в Арм.СХИ дисциплина “Лесное и садово-парковое хозяйство”. Параллельно с совершенствованием учебных программ на кафедре ведется обширная научная, учебно-методическая, а также исследовательская работа, направленная на решение актуальных проблем лесоведения и озеленения населенных пунктов. Кафедра тесно сотрудничает с различными научно-образовательными учреждениями, в том числе с Институтом ботаники НАН РА, с ботаническими садами Еревана, Ванадзора и Севана, служащими научно-исследовательской и учебно-практической базой.

Кафедра ведет тематические исследования биоэкологических аспектов восстановления деградированных лесов республики, улучшения сортового состава и декоративности дендрофлоры зеленых насаждений Еревана. К этим исследования привлечены почти все сотрудники кафедры.
Большое содействие в создании учебной базы кафедры оказала лесоинженерная школа Шведского университета сельскохозяйственных наук, тесные связи с которой установлены с 2002 г. Много лет кафедра развивает активную деятельность по подготовке научно-педагогических кадров, повышению их квалификации, техническому оснащению лаборатории, изданию учебной и учебно-методической литературы. Активную помощь в этом вопросе оказывает Шведский университет сельскохозяйственных наук (2004-2007 гг.)