В 1927 г. в Ереванском государственном университете была основана кафедра виноградарства. В 1930 г. она была переведена во вновь созданный Армянский сельскохозяйственный институт. В 1933 г. были образованы кафедры плодоводства и защиты растений.

В 1947 г. кафедра садоплодоводства была объединена с кафедрой переработки винограда и плодов и переименована в агровинодельческую.
После образования в 1994 г. Армянской сельскохозяйственной академии кафедры виноградарства, плодоводства и овощеводства были объединены, а в 1997 г. была сформирована кафедра садоплодоводства и защиты растений.

В 2013-2018 гг. кафедрой руководил канд. с.-х. наук, доцент А. Дж. Тер-Григорян. С февраля 2019 г. кафедрой руководила А.А. Манвелян. С сентября 2022 г. обязанности завкафедрой исполняет декан агрономического факультета, доцент А. Дж. Тер-Григорян.
Кафедра готовит квалифицированные кадры в области виноградарства, плодоводства, защиты растений, селекции и выведения новых сортов. Сотрудниками кафедры опубликовано более тысячи научных статей, множество брошюр научно-практического характера, учебников, учебных пособий, монографий.
При кафедре действует научно-исследовательская лаборатория виноградарства и плодоводства, основателем которой был профессор П.К. Айвазян, руководивший ею в 1970-2008 гг. За эти годы был создан богатый фонд виноградных гибридов, который включает в себя 35 тыс. сеянцев и 550 элитных гибридов.
Сотрудниками кафедры также созданы 24 универсальных и технических сорта винограда с различными сроками созревания (авторы профессора П.К. Айвазян и Г.П. Айвазян). В соавторстве с доцентом Г.С. Сантросяном ими получено 3 новых селекционных сорта абрикоса. На кафедре ведутся работы по разработке и внедрению новых систем формирования виноградной лозы, а также новых технологий обработки абрикосовых деревьев. Сотрудники кафедры осуществляют также фитосанитарную экспертизу на зерновых полях РА, исследуют особенности и выявляют болезни и вредителей растений, разрабатывают методы борьбы с ними.

Кафедра сотрудничает с Продовольственной и сельскохозяйственной организацией ООН, университетом г. Орлеан (Франция), с селекционным центром г. Крымска Краснодарского края, различными подразделениями министерства сельского хозяйства РА, фермерскими хозяйствами и частными землепользователями.
Сотрудники кафедры проводят консультативную работу в различных марзах республики.На кафедре проводят научные работы аспиранты и соискатели различных специальностей. Ведется также последовательная работа в организации научных исследований студентов.